日本脑炎病毒探针法荧光定量RT-PCR试剂盒
产品及特点：
日本脑炎病毒(Japanese Encephalitis Virus,JEV)是一种 RNA 病毒，也是流行性乙型脑炎的病原体，在低温条件下，该病毒能自下而上较长时间，在动物、鸡胚及组织培养细胞中均能增殖。幼猪是乙脑病毒的主要传染源和中间宿主，蚊子是乙脑病毒的传播媒介。当人受带病毒的蚊子叮咬后，乙脑病毒进入人体，在血管内皮细胞、淋巴结、肝、脾等吞噬细胞内增殖，并经血液循环到达脑部而引起炎症，因此日本脑炎病毒的快速准确鉴定对该病的预防和检疫有着重要作用。本产品基于 PCR 原理开发。
它具有下列特点：
1. 即开即用，用户只需要提供样品 RNA 模板。
2. 引物和探针经过优化，灵敏性高。
3. 提供阳性对照，便于区分假阴性样品。
4. 特异性高，引物是根据日本脑炎病毒高度保守区设计，不会跟其他病毒的RNA发生交叉反应。
5. 本产品足够 50 次 20μL 体系的探针法荧光定量 RT-PCR 反应。
6. 本产品只能用于科研。
规格及成分：

编号	成分	规格
试剂一	探针法 qRT-PCR 缓冲液	500 μL（蓝盖）
试剂二	探针法 qRT-PCR 酶混合液	100 μL（红盖）
试剂三	荧光 PCR 专用模板稀释液	1 mL（黄盖）
试剂四	日本脑炎病毒探针法qRT-PCR引物混合液	100 μL（白盖）
试剂五	日本脑炎病毒qRT-PCR 探针	50 μL（棕色管）
试剂六	日本脑炎病毒探针法qRT-PCR阳性对照(1×10E8 /μL)	50 μL（黄盖）
使用手册		1 份

运输及保存：
低温运输，-20℃保存，保存期限为 12 个月。
自备试剂： 
样品 RNA。
使用方法：
一、稀释标准曲线样品（以 10E2-10E7 拷贝/μL 这 6 个 10 倍稀释度为例）：
由于标准品浓度非常高，因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行，千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分）。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原，本产品不提供活体样品做阳性对照，只提供无传染性的 DNA 片段作为阳性对照。
1. 标记 6 个离心管，分别为 7，6，5，4，3，2。
2. 用带芯枪头分别加入 45 μL 荧光 RT-PCR 专用模板稀释液，最好用带芯枪头，下同）。
3. 在 7 号管中加入 5 μL 1×10E8 拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供)，充分震荡 1 分钟，得 1×10E7 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
4. 换枪头，在 6 号管中加入 5 μL 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得)，充分震荡 1 分钟，得 1×10E6 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
5. 换枪头，在 5 号管中加入 5 μL 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得)，充分震荡 1 分钟，得 1×10E5 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
6. 重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
二、样品 RNA 的制备：
7. 如果有 N 个样品，最好设置 N+2 个提取，多出的一个是 PC（样品制备阳性对照），一个是 NC（样品制备阴性对照）。可以用 10μL 阳性对照的 10000倍稀释液再加上一定量的水使总体积跟每次制备要求的体积一样，以此作为PC。另外用水作为 NC。
8. 用自选方法纯化样品的 RNA，本试剂盒跟市场上大多数病毒 RNA 提取试剂盒兼容。也可以选购本公司的柱式病毒 RNAout。
三、Probe qRT-PCR 反应（20μL 体系，在样品制备室进行）：
9. 如果做定量分析并且只做 1 次重复，则标记 N+9 个 PCR 管，其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品，1 个用于 PCR 阴性对照（用水做模板），6个用于标准曲线。如果做定性分析，并且只做 1 次重复，则标记 N+4 个 PCR管，其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品，1 个用于 PCR 阴性对照（用水做模板），1 个用于 PCR 阳性对照（用第 4 号管的阳性对照稀释液做模板）。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
10. 在标记管中按下表加入各成分（本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照，并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后加）：

编号	成分	规格
试剂一	探针法 qRT-PCR 缓冲液	500 μL（蓝盖）
试剂二	探针法 qRT-PCR 酶混合液	100 μL（红盖）
试剂三	荧光 PCR 专用模板稀释液	1 mL（黄盖）
试剂四	日本脑炎病毒探针法qRT-PCR引物混合液	100 μL（白盖）
试剂五	日本脑炎病毒qRT-PCR 探针	50 μL（棕色管）
试剂六	日本脑炎病毒探针法qRT-PCR阳性对照(1×10E8 /μL)	50 μL（黄盖）
使用手册		1 份

11. 盖上盖子后上机，按下面参数进行 qRT-PCR： 

过程	温度	时间
逆转录	50℃	30 min
预变性	94℃	10 min
qRT-PCR反应35个循环	94℃	15 sec
	60℃	1 min，(采集FAM通道的荧光信号)

四、数据处理：
12. 如果把本试剂盒用于定量检测，则以阳性对照浓度的 log 值为横轴，以 Ct值为纵轴，绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品RNA 浓度的 log 值，再推算出其浓度。
13. 如果把本试剂盒用于定性检测，只判断阳性或阴性，则阴性对照 Ct 必须大于或等于 40。阳性对照必须有荧光对数增长，有典型扩增曲线，Ct 值应该小于或等于 30。对待测样品，如果其 Ct 大于或等于 40 则为阴性，如果小于或等于 35 则为阳性。如果在 35-40 之间，则重复一次。重复实验的 Ct值如果大于或等于 40 则为阴性，如果小于 40，则为阳性。